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WEBINAR # 15 | 20 de septiembre 2024
Dra. Kattia Nuñez Montero
Universidad Autónoma de Chile
La Antártida es un continente inhóspito y con condiciones extremas. Las bacterias que allí habitan han desarrollado adaptaciones únicas para sobrevivir dichas condiciones. Resultado de ello, pueden ser una fuente valiosa de recursos genéticos con potenciales aplicaciones, en especial en la búsqueda de nuevos productos naturales para uso biomédico y agrícola. Por su parte, los avances recientes en adquisición y análisis de datos -ómicos han sido fundamentales en la explotación de estos recursos, permitiendo profundizar en el conocimiento sobre la genética y metabolismo de los microorganismos. Nuestro grupo de investigación ha indagado en la diversidad de bacterias antárticas, obteniendo una colección con más de 200 cepas, de las cuales se cuenta con el 15% de los genomas completos secuenciados. En este contexto, el objetivo del presente trabajo fue estudiar recursos genéticos microbianos con posibles aplicaciones clínicas y agrícolas de sus moléculas bioactivas a través de la caracterización del genoma y metaboloma de bacterias antárticas. Para esto, se realizaron ensayos de bioactividad contra microrganismos patógenos humanos y fitopatógenos. Además, se estudió el metaboloma de las cepas en distintas condiciones de cultivo mediante extracción orgánica, detección con UHPLC-QTOF-MS/MS y análisis de redes de interacción molecular. Seguidamente se secuenció el genomas de cepas con resultados de bioactividad positivos, utilizando un enfoque híbrido de ensamblaje con las tecnologías Illumina y Oxford Nanopore Technologies. Como resultado se destacó la capacidad de producción de compuestos antimicrobianos en las cepas Streptomyces fildesensis So13.3, Massilia sp. Dwa41.01b, Pseudomonas sp. So3.2b y Sphingomonas sp. So64.6b, siendo estas últimas posibles nuevas especies según la comparación de genoma completo con los miembros de sus respectivos géneros; las cuales además presentan elementos genéticos indicativos de adaptación al continente antártico. Debido a que los recursos genéticos de las bacterias antárticas ofrecen un potencial significativo en diversas áreas, actualmente se trabaja en la caracterización por secuenciación de meta-amplicones ARNr 16S de trasplantes microbianos. Se pretende la conservación y aplicación de trasplantes que contengan la diversidad actual de microorganismos de ambientes con bajo impacto antropogénico y con potencial biotecnológico futuro.
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